Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80Q9ULG1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms