Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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RABGEF1Q9UJ41 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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RABGEF1Q9UJ41 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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RABGEF1Q9UJ41 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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RABGEF1Q9UJ41 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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RABGEF1Q9UJ41 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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RABGEF1Q9UJ41 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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RABGEF1Q9UJ41 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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RABGEF1Q9UJ41 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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RABGEF1Q9UJ41 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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RABGEF1Q9UJ41 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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RABGEF1Q9UJ41 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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