Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH4Q9UIA0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH4Q9UIA0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH4Q9UIA0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH4Q9UIA0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH4Q9UIA0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH4Q9UIA0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH4Q9UIA0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH4Q9UIA0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYTH4Q9UIA0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH4Q9UIA0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYTH4Q9UIA0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms