Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPN3Q9UHW5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms