Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBQLN2Q9UHD9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBQLN2Q9UHD9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBQLN2Q9UHD9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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