Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms