Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPC1L1Q9UHC9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms