Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms