Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM5BQ9UGL1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms