Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms