Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms