Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSPNQ9HAW4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms