Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHARPINQ9H0F6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms