Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms