Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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FOXQ1Q9C009 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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FOXQ1Q9C009 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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