Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SNHG12Q9BXW3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms