Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms