Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms