Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms