Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms