Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREX2Q9BQ50 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms