Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms