Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms