Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms