Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAMKK2Q96RR4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMKK2Q96RR4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms