Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms