Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms