Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms