Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms