Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STAMBPL1Q96FJ0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms