Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms