Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms