Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms