Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms