Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A1Q93096 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms