Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms