Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms