Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms