Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms