Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
DTX3Q8N9I9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms