Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms