Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF182Q8N6D2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF182Q8N6D2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF182Q8N6D2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF182Q8N6D2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF182Q8N6D2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF182Q8N6D2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF182Q8N6D2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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RNF182Q8N6D2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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RNF182Q8N6D2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF182Q8N6D2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF182Q8N6D2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF182Q8N6D2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF182Q8N6D2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RNF182Q8N6D2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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RNF182Q8N6D2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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