Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U1

MS4A15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A15Q8N5U1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MS4A15Q8N5U1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms