Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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