Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNTROBQ8N137 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTROBQ8N137 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms