Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP3Q8IZU3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP3Q8IZU3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP3Q8IZU3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP3Q8IZU3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP3Q8IZU3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP3Q8IZU3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP3Q8IZU3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP3Q8IZU3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP3Q8IZU3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP3Q8IZU3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYCP3Q8IZU3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms