Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDPD3Q7L5L3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms