Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS62

COLCA1, Colorectal cancer-associated protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA1Q6ZS62 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COLCA1Q6ZS62 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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