Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR88Q6ZMY6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms