Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms